Il Museo dei Cappuccini offre itinerari didattici per le scuole studiati sulla base dei programmi scolastici e sul patrimonio esposto, anche modulati su precisa esigenza degli insegnanti. In particolare, grazie all’itinerario manzoniano, si richiama l’attenzione sulla storia di Milano all’epoca della peste del 1630, e nel contempo sulla figura di Manzoni studiata osservando le diverse edizioni de I promessi Sposi.

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Si propongono, inoltre, incontri mensili di matrice iconografica dedicati al pubblico adulto (il martedì) e delle visite-conferenze nelle sale del museo (il sabato).

Questi appuntamenti sono una particolare formula di incontro in museo come simili ad una visita guidata, ma comodamente seduti davanti al capolavoro in oggetto, come in una conferenza.